广州中医药大学目前共有 2个主要校区，分别是 三元里校区 和 大学城校区。不同专业的分布情况如下：
1. 三元里校区（老校区）
地理位置：广州市白云区机场路12号
主要功能：以 临床医学、研究生教育、继续教育 为主，部分本科高年级学生在此进行临床实习。
分布专业：
中医学（部分高年级临床方向）
针灸推拿学（临床实践阶段）
研究生院（硕士、博士培养）
附属医院相关临床教学（如第一附属医院、第二附属医院）
2. 大学城校区（主校区）
地理位置：广州市番禺区广州大学城外环东路232号
主要功能：本科教育主体校区，涵盖大部分本科专业及基础教学。
分布专业：
中医学（五年制、八年制）
针灸推拿学
中药学
药学
护理学
康复治疗学
医学检验技术
公共卫生与管理类
补充说明
国际学院（如中医、针灸的留学生教育）通常设在大学城校区。
附属医院（如广东省中医院）作为临床教学基地，不单独算作校区，但承担实习任务。
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